關於黃奕瑞的故事有很多，以下是幾個：
1. “黃公賣馬”：有一回，黃奕瑞陪孫中山先生路過杭州，小住“武林棧”。有一天，孫中山先生散步歸來，心情十分舒暢，便向黃奕瑞問道：“你知道我們馬販子中間有一句俗話嗎？”黃奕瑞搖頭表示不知道。孫中山先生於是吟道：“黃公賣馬，來日方長。”意思是馬販子要把最好的馬賣給那些慕名而來的買家。對孫中山的這一詼諧詩句報以輕鬆的微笑，隨即又說：“老先生也要有個日限了！”隨後談起了下層人的生計之困難和政治的必要等等，他甚至非常推崇那個帶頭高唱“孫大炮”的林祥謙工友稱“拆橋要小心！”而決不是怕擔危險之徒，實在是言為心聲，唱出了民間的真情和聲音。
2. 拒賄事件：一次，“秦樓楚館”里有兩位一拐一拐、長辮盤在頭上的兩位小伙子對黃奕瑞說：“小王爺要來啦，馬上要去南京咧！”此言一出，大家趕忙招待“小王爺”。不想不一會兒來了兩個人，衣帽不周、操一口揚州腔。前一位拿出一包用洋紙精製的捲菸送給黃奕瑞。黃奕瑞說：“你不要這樣，不要這樣！今天小王爺沒來，來的不是我。”對方仍不死心，又把煙遞到另一位陪同人員的面前。那人連忙擺手說：“不要不要！”那人悻悻而去。事後，大家議論紛紛。有人認為“小王爺”是要來的人；有人認為黃奕瑞不是“小王爺”本人，也決不是他的侍從；有人認為黃奕瑞之所以這樣講是出於清廉自守。
以上就是關於黃奕瑞的一些故事，從中可以看出他具有良好的個人品質和清廉的作風。