黑殼蝦的孵化過程主要包括以下幾個步驟：
配對和產卵。成熟的雄蝦和雌蝦配對後，雌蝦會在水草叢中、石塊下等隱蔽的地方產卵。
保護卵粒。雌蝦會在卵粒周圍堆積泥沙等物質，形成一箇“蒙版”，保護卵粒不受外界干擾，同時也爲卵粒提供充足的氧氣。
孵化。卵粒孵化一般在3-5天左右，孵化後的小蝦脫離卵殼，成爲游泳幼蟲。
孵化環境。孵化環境應保持適宜的溫度和溼度，通常使用孵化箱或保溫箱，並使用透明的塑料水箱，溫度保持在28℃左右，相對溼度在80%以上。如果沒有孵化箱，可以將黑殼蝦卵單獨挑出來放在魚缸裏，再加入一箇加熱棒，使溫度保持在28℃左右，相對溼度在80%以上，要保持環境的穩定不受溫度和溼度的波動。
孵化操作。將黑殼蝦卵放入孵化容器內，注意不要把水箱搖晃，以免破壞蝦卵。將容器放入孵化箱或者保溫箱內，並輕輕安排好黑殼蝦卵的位置。開啓加熱棒，保持環境的適宜溫溼度。在孵化過程中，建議每天檢查一下黑殼蝦卵的狀態，如果有空殼出現，可能代表有部分蝦卵已經孵化出了小蝦仔，此時應該及時將小蝦仔過渡到幼小蝦缸內。
此外，如果不想放棄蝦卵，可以採取人工孵化，只需將蝦卵從母體一粒一粒取下並置於有水流緩緩流過的地方並等待蝦卵孵化即可。