水體缺氧和有機物腐敗
黑臭河道的主要原因是水體缺氧和有機物腐敗。
這種情況通常是由於水體中有機污染物的過量輸入和積累造成的，導致水體出現強烈的還原環境，水體中溶解氧水平降低。在這個過程中，厭氧微生物的作用下，有機物分解產生硫化氫、氨氮等有害氣體和黑色或黃色物質，導致水體變黑變臭。
具體原因包括外源性污染輸入，如工業廢水、生活污水、雨水、垃圾和農田化肥的直接排放；內源性污染，如河道底泥的積累和持續污染；水繫結構問題，如河道流動性差、水體交換能力弱；以及河道功能的異化，如城市河道被用作納污通道等。
此外，水生態系統破壞也是一個重要因素，包括生物多樣性的喪失和水體淨化能力的下降。