黑麴黴的菌落特徵主要包括以下幾點：
菌落的初始顏色為白色，隨後變為鮮黃色，最終成為黑色厚絨狀。
菌落的背面通常無色，或中央部分略帶黃褐色。
頂部形成球形頂囊，其上覆蓋著一層梗基和一層小梗，小梗上長有成串的褐黑色球狀分生孢子，這些孢子的直徑約為2.5~4微米。
分生孢子頭的直徑約為700~800微米，呈褐黑色。
此外，黑麴黴還具有以下特徵：
分生孢子梗的長度不一，光滑且可能是無色至褐色。
菌絲髮達，具有隔膜和多分枝。
在特定的生長條件下，如高溫和高濕度，黑麴黴能引起水分較高的糧食霉變和其他工業器材的霉變。它的生長適溫約為37℃，最低相對濕度為88%。
這些特徵使得黑麴黴成為一種在工業和農業上都具有重要影響的真菌。