CIBERSORT是一種基於線性支持向量回歸原理的免疫細胞浸潤估計分析工具，它能夠對人類免疫細胞亞型的表達矩陣進行去卷積，從而估計免疫細胞的豐度。該工具首次發表於2015年的Nature Methods雜誌。CIBERSORT適用於晶片表達矩陣和測序表達矩陣，在去卷積分析方面優於其他方法，如LLSR、PERT、RLR、MMAD和DSA等。
使用CIBERSORT進行免疫分析時，需要下載22種常見的免疫浸潤細胞表達數據LM22檔案，以及準備基因表達矩陣檔案。以下是操作步驟的概述：
安裝所需的R包，如ggplot2、reshape2、ggpubr、dplyr和RcolorBrewer。
載入所需的R包。
讀取檔案，包括LM22.txt（22種免疫細胞表達量檔案）和combined.expr.txt（表達矩陣檔案）。
使用CIBERSORT算法進行免疫浸潤分析，設定置換次數perm為50，如果使用的是晶片數據則QN設定為T，如果是測序數據則設定為F。
將分析結果保存為GEO_CIBERSORT.txt檔案。
以上步驟可以幫助用戶利用CIBERSORT工具進行免疫細胞的豐度分析，從而為研究提供有價值的數據和信息。