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dpgen教程

DP-GEN是一個用於第一性原理計算和機器學習相結合的軟體,用於訓練和最佳化深度勢能(Deep Potential)模型。以下是一個基本的DP-GEN教程:

準備初始運行檔案。首先,需要準備運行DP-GEN所需的檔案,包括machine.jsonINCARparam.json等。machine.json檔案用於配置計算資源,如節點數量和類型;INCAR是VASP等第一性原理計算軟體的標準輸入檔案,用於設定計算參數;param.json是DeePMD-kit的參數檔案,用於配置深度勢能模型。

開啟節點。在Bohrium平台上,需要先開啟一個計算節點,這通常涉及到登錄到遠程節點並使用SSH工具。在Bohrium的節點管理頁面,選擇「啟動節點」並選擇「鏡像製作節點」,然後通過SSH連線到遠程節點並登錄。

工作環境檢查。確保DP-GEN及其依賴的庫已經正確安裝,可以通過在命令行輸入`dpgen -h`來檢查DP-GEN的版本和依賴庫。

提交任務與監測任務狀態。在Bohrium平台上,提交任務並監測其狀態,確保計算正常進行。

獲取運行結果。計算完成後,可以從Bohrium平台獲取運行結果,包括訓練模型的詳細信息和性能評估。

此外,DP-GEN還涉及到其他步驟,如init_bulk過程(準備訓練的初始數據集)、run過程(執行訓練和模擬),以及分析訓練後的模型等。