GAP分析法有兩種主要的套用領域：
保護生物多樣性。作為保護生物多樣性的地理學方法，它通過綜合考慮區域植被、重要物種適宜生境的分布、土地所有權和保護區等方面的空間信息，利用地理信息系統（GIS）進行空間分析，找出不同植被類型、重要物種分布與保護區之間的關係。這種方法在較大空間尺度上提供一個地區的生物多樣性組成、分布與保護狀況的概況，尋求沒有出現在生物多樣性保護區網路中的植被類型和瀕危物種的保護空白地區，以便在土地管理實踐中或通過新建保護區來填補。其目的是保護瀕危物種和生物多樣性，確保在保護計劃中有代表性的植被類型、重要物種、生物多樣性高的生態系統都得到保護。
戰略分析。在戰略管理中，GAP分析（又稱差距分析或差異分析）是一種用於評估戰略實施過程中實際業績與期望業績之間差距的方法。它涉及收集資料和數據、植被作圖、製作物種分布圖、製作物種豐富度圖、製作土地所有權和管理狀態圖、分析保護空缺等步驟。這種分析有助於識別和解決在實現戰略目標過程中存在的差距，通過改變目標或調整戰略來減少或消除這些差距，從而提高整體業務績效。