GC含量是指在DNA或RNA中,鳥嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比例。在雙鏈DNA中,腺嘌呤(A)與胸腺嘧啶(T)的比例以及鳥嘌呤與胞嘧啶的比例都是1:1。GC含量不僅影響DNA的密度和穩定性,使得DNA更難以通過熱或鹼變性,而且對PCR反應、測序引物和雜交探針的設計也有重要影響。一般來說,PCR反應的GC含量在40%到60%之間最為適宜,而測序引子和雜交探針的GC含量則建議至少為50%。GC含量可以通過計算公式[(G+C的總數量)/(A+T+C+G的總數量)] * 100%來得出,用百分比表示。G-C鹼基對由三個氫鍵連線,而A-T鹼基對由兩個氫鍵連線,因此GC含量越高,DNA的穩定性越好。此外,GC含量還會影響mRNA的二級結構及PCR過程中DNA模板的退火溫度。