GIS（地理信息系統）支持多種檔案格式，主要包括：
矢量GIS檔案格式。這種格式由頂點和路徑組成，包括點、線和面等基本符號類型。
柵格GIS檔案格式。由像素（格線單元）組成，可關聯連續值或離散類。
壓縮光柵檔案格式。通過消除冗餘信息來減小檔案大小。
地理資料庫檔案格式。用於存儲結構化的地理數據。
關係資料庫管理系統(RDBMS)。常用於多用戶編輯環境，支持網路上的版本編輯、備份和恢復。
雷射雷達(LiDAR)檔案格式。記錄高程值的坐標點密集網路，用於精確地圖繪製。
計算機輔助設計(CAD)檔案格式。常用於構建設計模型，後導入GIS中。
高程檔案格式。特定於數字高程模型產品。
網路檔案格式。專門用於通過網路提供和顯示地理特徵。
多時態檔案格式。附加時間組件的GIS數據，常用於存儲天氣數據和時間趨勢等。
GIS軟體項目檔案格式。用於存儲分層圖層和地圖構建屬性。
製圖檔案格式。用於標準化地圖創建，通常不保存物理數據。
3D檔案格式。用於顯示三維地理數據。