Markdown支持數學公式的輸入，使用$和$$來界定公式。單$用於行內公式，即公式與文字混排在同行；雙$$用於塊級公式，即公式獨占一行或多行。
上下標：使用^表示上標，_表示下標。如果上下標內容超過一個字元，用{}括起來。例如：x^2 + x^{y^2} 或 x_1^2 + y_1 - y_2^{x_1 - y_1^2}。
希臘字母：Markdown使用反斜槓加字母來表示希臘字母。例如，小寫α使用\alpha，大寫Γ使用\Gamma。
運算符：Markdown提供了一些常用的運算符，如加號+、減號-、乘號\times、除號/等。對於更複雜的運算符，如積分、求和等，可以使用特定的命令。
累加與累乘：累加使用\sum_{下標表達式}^{上標表達式} {累加表達式}，累乘使用\prod_{下標表達式}^{上標表達式} {累加表達式}。例如，行內公式為$\sum_{k=1}^n k = \frac{n(n+1)}{2}$，行間公式為$$\sum_{k=1}^n k = \frac{n(n+1)}{2}$$。
以上是Markdown公式輸入的基本語法，通過這些語法可以方便地插入各種數學公式。