《合金裝備5：幻痛》的故事發生在《合金裝備4》的故事之後，玩家扮演的Snake進入了一個未知的熱帶雨林，並開始了新的冒險。
在這個遊戲中，玩家可以探索一個巨大的開放世界，並完成任務和對話來增加角色。遊戲的主要特點是其開放性，玩家可以選擇不同的路徑來完成任務和收集物品。此外，玩家還可以與其他玩家合作或戰鬥，並且可以收集武器和裝備來定製Snake的武器庫。
在故事中，玩家將面臨許多選擇，這些選擇將對最終的遊戲結局產生影響。此外，遊戲還包含一些戰鬥元素，玩家可以使用各種武器和裝備來與敵人進行戰鬥。最終，玩家將面臨遊戲中的BOSS戰，並做出最終的決定來改變自己的命運。