Meta分析軟體有很多種，主要可以分為非編程軟體和編程軟體兩大類。非編程軟體包括：
RevMan。由國際Cochrane協作網開發，專門用於系統評價和Meta分析。它提供了清晰易用的界面，適合進行RCT（隨機對照試驗）的Meta分析。
Comprehensive Meta-Analysis (CMA)。這是一款商業軟體，適用於各種Meta分析需求，包括定量的發表偏倚檢驗和Meta回歸分析。
Meta-DiSc。這是一款專注於診斷試驗Meta分析的免費軟體，操作簡單，但版本和分析方法可能有些過時。
MIX。基於Excel開發，適用於有VB語言基礎的用戶，提供互動式的解釋和可視化功能。
Meta Win。一款較舊的商業軟體，提供基本的Meta分析功能，有體驗版可供下載。
編程軟體主要包括：
Stata。一款功能強大的統計分析軟體，需要通過添加特定的選單和代碼包來進行Meta分析。它提供了強大的作圖功能，適合進行複雜的統計分析。
R語言。基於S語言開發的免費開放原始碼編程環境，適合進行各種複雜的Meta分析。R語言需要通過引入特定的程式包（如metafor和dmetar）來進行Meta分析，它提供了極大的靈活性和強大的繪圖功能。
選擇哪種軟體取決於研究的具體需求、個人的編程背景以及是否願意學習使用新的軟體。對於初學者，RevMan和CMA等非編程軟體可能更為友好；而對於熟悉統計編程的研究者，Stata和R語言則提供了更多的靈活性和功能。