RPKM值是衡量基因表達量的重要指標,其全稱為Reads Per Kilobase per Million mapped reads,直譯為每百萬映射讀段中來自某基因每千鹼基長度的讀段數。
RPKM值通過將比對到某個基因的讀段數除以比對到基因組上的所有讀段數(以百萬為單位)和基因長度(以千鹼基為單位)來計算,這個指標可以消除基因長度和測序量差異對基因表達量估算的影響,使得不同樣本間的基因表達量比較更加準確。
此外,RPKM值常與其它量化基因表達的數值如FPKM和TPM等比較。
RPKM值是衡量基因表達量的重要指標,其全稱為Reads Per Kilobase per Million mapped reads,直譯為每百萬映射讀段中來自某基因每千鹼基長度的讀段數。
RPKM值通過將比對到某個基因的讀段數除以比對到基因組上的所有讀段數(以百萬為單位)和基因長度(以千鹼基為單位)來計算,這個指標可以消除基因長度和測序量差異對基因表達量估算的影響,使得不同樣本間的基因表達量比較更加準確。
此外,RPKM值常與其它量化基因表達的數值如FPKM和TPM等比較。