序列比對格式
SAM是一種序列比對格式標準，全稱為Sequence Alignment/Map format。
SAM檔案通常包含兩個主要部分：頭部區和主體區，其中頭部區是可選的，以「@」字元開始，包含比對的一些總體信息，如比對的SAM格式版本、參考序列、使用的比對軟體等；主體區則是比對結果，每一行代表一個比對結果，包含11個主要列和一個可選列。這種格式是以制表符分隔的文本檔案，主要用於表示測序序列映射到基因組上的結果，也可以用於表示任意的多重比對結果。
此外，SAM的二進制版本被稱為BAM，BAM是SAM的二進制檔案（B取自binary）。