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stamp分析

STAMP是一款功能強大的組間差異分析軟體,主要用於宏基因組學和其他相關領域的數據分析。它能夠處理多種類型的組間差異分析,包括物種分布豐度差異、基因差異、功能差異等。STAMP於2014年發表在Bioinformatics上,由於其廣泛的適用性和高效的性能,已經被引用數百次。

STAMP的主要特點包括:

廣泛的適用性:適用於物種注釋(不同層級的物種豐度)和功能注釋(不同代謝通路的基因豐度)等宏基因組概況的分析。

效應大小和置信區間:使用效應大小和置信區間來評估生物學重要性,幫助選擇合適的統計檢驗方法和可視化結果。

用戶友好的界面:提供用戶友好的圖形界面,方便用戶探索統計結果和生成高質量的出版物級別統計圖。

開源和可擴展:STAMP是開源的,可以通過外掛程式框架進行擴展,支持所有主要平台。

此外,TUTU網站提供了STAMP分析工具的線上分析功能,允許用戶無需安裝軟體即可實現組間差異的可視化分析,進一步提高了STAMP的易用性和普及性。