東莞市境內的高鐵站主要包括以下幾個：
虎門站。位於東莞市虎門鎮，是廣深港高速鐵路的中間站，也是東莞市西南部的交通樞紐。
東莞南站。位於東莞市塘廈鎮，是贛深高鐵東莞段唯一站點，規模在贛深鐵路新建車站中排第二大。
樟木頭站。位於東莞市樟木頭鎮，是中國鐵路廣州局集團有限公司管轄的客貨三等站，主要服務廣深城際列車。
樟木頭東站。位於東莞市，是廣東城際鐵路運營有限公司管轄的客運四等站，屬於廣惠城際鐵路的中間站。
銀瓶站。位於東莞市謝崗鎮東部片區，屬於廣惠城際鐵路的客運站。
以上各站均提供了高鐵服務，連接了廣東省內的多箇城市，促進了區域交通的發展。