乾枸杞最好的保存方法是冷藏法，即先將枸杞密封在具有良好密封性的容器或袋子中，然後放置在冰櫃的冷藏室（0到4攝氏度）保存。
這種方法簡單實用，能有效延長枸杞的保存時間。在冷藏前，請確保枸杞完全乾燥，否則易受潮和滋生細菌。此外，還可以使用塑膠袋真空保存法，這種方法涉及在塑膠袋中放入乾燥劑（如生石灰），然後抽出袋內空氣，確保環境乾燥。
也可以選擇密閉瓶保存法，使用乾淨的玻璃瓶或塑膠瓶，將枸杞倒入瓶中並密封。建議使用無毒性的塑膠袋密封存放，並在使用後儘量排出袋內空氣。
乙醇保管法也是一種選擇，涉及將枸杞與乙醇噴霧混合後密封存放。這種方法可以防蛀並保持枸杞色澤。
無論哪種方法，都應確保儲存環境乾燥、陰涼、避光，並定期檢查以防蟲害或變質。如果發現枸杞受蟲害，建議通過曬乾的方式進行清理。