金瓶掣籤制度是清朝政府爲加強對西藏等地區的管理，確保活佛轉世的公正性而設立的一項制度。
這種制度主要應用於藏傳佛教中地位較高的大活佛的轉世靈童認定過程。金瓶掣籤制度正式成立於清朝乾隆五十七年（1792年），規定在尋找大活佛的轉世靈童時，將候選者的名字用滿文、漢文、藏文分別寫在象牙籤上，然後放入金制的瓶子中。隨後，由喇嘛們誦經並從金瓶中隨機抽取名字。這一過程需要理藩院尚書或駐藏大臣的監督，並需得到中央政府的批准，確保轉世的合法性和公正性。
金瓶掣籤制度的設立，不僅提高了駐藏大臣的權力，也加強了中央政府對蒙藏地區的控制，有效防止了當地貴族操縱大活佛的轉世，維護了國家的統一和穩定。