佛手瓜育苗的方法有多種，包括種瓜育苗法、光胚育苗法、扦插育苗法等。種瓜育苗法適用於少量育苗，選擇無損傷、個大無傷的種瓜，將其首端的合縫處開口，裝入塑膠袋中，放在15~20℃的環境下催芽，約15天後種瓜會長出根系和子葉，然後可以播種。光胚育苗法適用於大量育苗，取佛手瓜的幼芽，將其從種瓜上取出，可以直接播種或保存，出苗前溫度控制在15~20℃，出苗後降至10~15℃。扦插育苗法是利用佛手瓜的莖切段進行扦插，培育出健壯的秧蔓，剪斷成2~3個節段的插條，處理後插入育苗基質中。
無論哪種方法，育苗時都應注意控制適宜的溫度和濕度，避免種瓜腐爛或幼苗徒長。在幼苗期，應避免過度澆水和暴露於強烈陽光下。當幼苗長到一定程度時，可以進行移栽，繼續培養。