南京較好的日本料理店包括汀蟬、鮨一、鮨極、水之惠、坂亭府、魚四季創作日本料理、本湖月日本料理、煙花·爐端燒和古南都那古野日本料理。
這些餐廳提供多樣化的日本料理，包括懷石料理、會席料理、拉麵、壽司等，各具特色且人氣極高。例如，汀蟬以其高端的日本料理和較高的人均消費著稱；鮨一和鮨極則以Omakase（廚師發辦）的套餐形式和板前料理聞名；水之惠是一家面向普通大眾的老牌日料店；坂亭府以其鐵板燒特色而聞名；魚四季創作日本料理以豐富的菜品和新鮮食材著稱；本湖月日本料理則位於玄武湖畔，提供安靜舒適的用餐環境；煙花·爐端燒填補了南京爐端燒這一日料種類的空白；古南都那古野日本料理則受到當地人的特別喜愛。