南姓的起源有多種說法，主要源自不同的歷史時期和族群。以下是南姓起源的幾種主要說法：
源自周代南仲之後：南姓出自周代南仲之後，以祖名為氏。據《姓源韻譜》記載，商王盤庚的妃子姜氏夢龍入懷，生下一子手握「南」字，長大後主管荊州，號為「南赤龍」。其曾孫南仲在周初擔任大夫，後世子孫遂以祖名為姓，稱南氏。
源自姬姓：南姓還出自姬姓，春秋時衛靈公之子公子郢，字子南，其支孫以祖字為姓，稱南氏。
源自姒姓：夏禹的後代中有南氏，也稱男氏或南國。商中期，古南國因二臣爭權而亡，分裂為二，一在今河南南陽，一在今湖北荊州。姒姓南氏的歷史大約有2800年。
源自羋姓：春秋時楚莊王之子追舒，字子南，其後有子南氏，後又改為南氏。羋姓南氏的歷史大約有2600年。
源自少數民族改姓：滿族南姓源自那拉氏，在清朝中葉以後，多冠漢姓為南氏。今藏、滿、回、蒙古、朝鮮、僳僳等民族均有改漢姓南氏者。
源自張姓：明孝宗孝康張皇後死後，其兩兄弟被問斬，子孫四處逃跑，四個方向便演化為後來東、南、西、北四個姓氏，南姓由此而來。
綜上所述，南姓的起源較為複雜，涉及多個歷史時期和族群。