南疆地區的城市主要包括：
阿克蘇市：位於阿克蘇地區，是一個充滿活力與美麗的城市。儘管不如烏魯木齊那樣繁華，但擁有獨特的魅力。阿克蘇地區下轄7縣、2市，總面積為13.25萬平方千米，人口約為272萬，GDP達到1739億，在新疆排名第三位，在南疆排名第一位。
巴音郭楞蒙古自治州：簡稱巴州，是南疆的一個重要行政單位，包含多個城市和縣。
克孜勒蘇柯爾克孜自治州：簡稱克州，也是南疆的一個重要行政單位，包含多個城市和縣。
喀什地區：包括喀什市等多個城市和縣。
和田地區：包括和田市等多個城市和縣。
以上列出的城市和地區構成了南疆的主要城市群，各自擁有獨特的文化和歷史背景。