天然酵素是一種由胺基酸組成的具有特殊生物活性的物質，存在於所有活的動植物體內。
天然酵素在維持機體正常功能、促進新陳代謝、消化食物、修復組織以及分解毒素等方面發揮著關鍵作用。酵素是化學反應的催化劑，可幫助身體代謝機能順暢，具有專一性，例如，不同物質需用不同酵素作用。人體內也會自然產生酵素，例如，當我們在口中咀嚼米飯的時候，口腔會分泌唾液澱粉酶，將部分澱粉分解成「糊精跟麥芽糖」，便會有飯越吃越甜的感覺。
此外，天然酵素也可以通過以動物、植物、菌類等為原料，添加或不添加輔料，經微生物發酵製得，其生物活性成分包含植物原料和微生物所提供的各種營養素和天然植物中的植物類功能性化學成分，以及發酵生成的一些活性物質，如胺基酸、肽類、維生素等。