微波爐的工作原理主要基於微波這種電磁波的特性和套用。微波爐內部有一個磁控管，它可以將電能轉化為微波輻射，這些微波的頻率大約為2.45GHz，當微波爐開啟時，磁控管內的加熱元件會釋放電子，這些電子在磁鐵的作用下向外螺旋運動，產生振盪電荷，從而形成連續的電磁微波流。
微波在微波爐的金屬腔體內反射，形成電磁場，當食物放入微波爐中時，這些微波會穿透食物，使食物中的水分子受到電磁場的影響而開始快速擺動，從而產生摩擦熱，達到加熱食物的目的。這種加熱方式可以使食物內外同時受熱，加熱速度快且均勻。
需要注意的是，微波爐不適合加熱金屬容器或某些特定物質，因為這可能會引起火花或危險。