鑑別天然水晶的方法有多種，以下是一些常用的方法：
觀察顏色和內部紋理。天然水晶通常呈現玻璃光澤或油脂光澤，顏色分布不均勻，可以看到內部生長紋理，如棉絮、裂痕等。
硬度測試。天然水晶的莫氏硬度為7，用碎石在其表面輕輕划動，不會留下痕跡。
感受手感。天然水晶質地溫潤細膩，手感冰涼，導熱性快。
光照觀察。天然水晶在陽光下能觀察到橫紋或柳絮狀物質，並發出光彩。
偏光鏡檢查。天然水晶在偏光鏡下轉動時，會出現四明四暗的變化。
特殊類水晶觀察。如草莓晶等特殊類水晶，可以通過光照查看內部礦物沉澱。
二色性檢查。天然紫水晶具有二色性，而人造水晶通常不具備這一特性。
使用放大鏡。用十倍放大鏡在透射光下檢查，能找到氣泡的基本上可以定為假水晶。
熱導儀檢測。天然水晶在熱導儀測試時，能上升至黃色二格。
需要注意的是，這些方法並不是百分之百準確，特別是對於高品質的合成水晶，有時難以區分。因此，在購買昂貴的水晶時，最好能到專門的鑑定機構進行鑑定。