撤銷案件的流程因案件類型和階段的不同而有所不同。以下是公安機關撤銷案件的一般流程：
公安機關需報經上級領導審查批準，並寫出撤銷案件報告。
對於決定撤銷的案件，公安機關應製作撤銷案件決定書，並寫出撤銷案件通知書。
公安機關將撤銷案件通知書報送檢察機關。
對於符合條件的案件，檢察機關可以決定撤銷案件。
以下是檢察機關撤銷案件的一般流程：
檢察機關收到撤案申請後，對案件進行審查。
審查結束後，檢察機關會對撤案申請做出裁決決定。
如果法院同意撤案，則會作出裁定書，告知案件撤銷。
在特定情況下，如犯罪嫌疑人已被逮捕，應當立即釋放並發給釋放證明書，同時通知原批準逮捕的人民檢察院。對於查封、扣押的財物及其孳息、檔案，或凍結的財產，除按照法律和有關規定另行處理的以外，應當解除查封、扣押、凍結，並及時返還或通知當事人。
此外，在刑事訴訟過程中，如果遇到特定情形，如情節顯著輕微、犯罪已過追訴時效期限、經特赦令免除刑罰等，根據《刑事訴訟法》的規定，不追究刑事責任，已經追究的，應當撤銷案件或者不起訴或終止審理或宣告無罪。