在《我的世界》遊戲中，水晶的挖掘方式取決於水晶的類型和生成的位置，具體可分為以下兩種：
下界水晶的挖掘。首先，需要前往下界，水晶礦床可以在下界堡壘中找到，使用鑽石鎬級別的工具挖掘黑色石岩，如果外表有藍色的水晶紋理，就找到了水晶礦床。挖掘時，需要確保周圍沒有其他方塊，以免損壞水晶礦塊。下界水晶分為地獄水晶和末地水晶，地獄水晶呈淡藍色，而末地水晶則是紫色。
主世界水晶的挖掘。在主世界的地下Y坐標為5到22的區域內可以找到紫水晶礦脈，使用鑽石鎬或更高級別的鎬子進行挖掘，紫水晶礦石可以通過熔爐燒制來獲得紫水晶。使用帶有精準採集附魔的鎬子可以直接將紫水晶礦石收集到背包中。
此外，要注意，使用鐵鎬也可以在遊戲的7到11層挖到水晶。