日本料理在材料使用上非常豐富多樣，包括但不限於以下幾種：
壽司。壽司是以米飯和各種海鮮魚類為主要材料，通過捏制組合而成。
天婦羅。天婦羅通常使用海鮮、新鮮蔬菜等材料，裹上蛋汁和麵粉調製的麵糊後油炸。
壽喜燒。壽喜燒的主要食材包括肉片和各種蔬菜，使用特殊的日式醬汁作為湯底。
拉麵。拉麵的湯底可以使用雞骨、牛肉、豬肉、海鮮等，配料包括各種蔬菜、肉類和海鮮。
咖喱飯。咖喱飯是將肉類、蔬菜和咖哩粉燉煮成醬汁，再搭配白飯食用。
炸豬排。炸豬排是使用厚切的豬肉片，裹上蛋汁、麵包粉及炸粉後油炸。
蕎麥麵。蕎麥麵通常搭配醬油、甜醬以及各種配料如雞蛋、天婦羅等。
烏龍麵。烏龍麵是由小麥粉製成的麵條，通常和醬油、砂糖調製的醬汁一起食用。
炸雞。炸雞通常使用醬油、鹽巴和不同香料調味，然後裹上麵糊油炸。
日式烤鳥。烤鳥串是將雞肉醃漬後燒烤而成。
此外，日本料理還使用一些特殊的調味料和食材，如味啉、七味粉、Ponzu醬、柚子胡椒、各類白子、魚肝、山椒粉等。在蔬菜方面，日本料理常用的有筍、蘿蔔、日本蕪菁、秋葵、乳瓜、牛蒡、蓮藕、芋頭等，這些也是漬物（鹹菜）的重要原料。