會計查賬流程通常包括以下幾個步驟：
準備查賬工作。這包括了解被查單位的具體情況、確定查賬的目的和範圍，以及選擇合適的查賬方法。
核對財務報表和會計憑證。這一步驟涉及審查會計報表的編制是否與賬簿上的相關數據一致，以及審查記賬憑證與原始憑證的內容是否相符。
審查銀行對賬單和發票等原始憑證。逐項確認收入和支出的真實性和準確性。
核對利潤表和資產負債表的一致性。檢查各種會計資料的相關記錄，包括但不限於原始憑證、記賬憑證、賬簿等，看是否存在不一致或計算錯誤。
編制查賬報告。根據查賬結果，編制詳細的查賬報告，記錄查賬過程、發現的問題以及相應的建議。
此外，查賬過程中可以運用多種方法，如順查法（按照會計業務處理的先後程式進行檢查）、逆查法（按照會計業務處理程式的相反方向檢查）、詳查法（對查賬期間的全部憑證、賬簿、報表進行全面審查）和抽查法（抽取部分項目進行審查並推斷全體情況），還可以使用審閱法、核對法、數據複合法等具體技術。