木瓜籽可以通過以下方式食用：
直接食用。開始時每天只吃一兩個木瓜籽，逐漸增加至1/4茶匙（1.25毫升）、1/2茶匙（2.5毫升）和1茶匙（5毫升）。
與蜂蜜搭配食用。將木瓜籽與1茶匙蜂蜜混合以減少苦味。
作為調味品使用。將木瓜籽磨碎後用作胡椒替代品，或在烹飪肉類前用其調味。
炒熟後食用。可以炒著吃，以補充微量元素。
製作藥膳。木瓜籽也可用於製作藥膳。
煮水飲用。將木瓜籽煮水，水溫適宜後加入蜂蜜飲用。
需要注意的是，木瓜籽的味道可能較苦澀，且直接食用可能會引起腹脹或消化不良等不良反應，因此建議適量食用，並採取適當處理方式。