製作木瓜酒的方法有多種，以下是其中一種常見的做法：
選擇新鮮、表面無傷、大小均勻的木瓜，削皮並切成小塊。
將木瓜塊、冰糖（或白砂糖）和糧食酒按一定比例放入消毒晾乾的玻璃瓶中，比例大約為1:0.3:0.5，即每100克木瓜用30克冰糖和50克白酒。
確保木瓜塊、冰糖和白酒之間層層疊加，最後密封瓶子。
將瓶子放在陰涼避光處，靜置一段時間（通常為1到3個月）讓木瓜和酒充分融合，具體時間可以根據個人口味調整。
此外，還有一種方法使用焦亞硫酸鉀和果膠酶來提高出汁率和殺菌抑菌，具體步驟為：
將破碎好的木瓜加入焦亞硫酸鉀，每十斤木瓜加入0.35克焦亞硫酸鉀粉末，加入8倍的純淨水，溶解後加入木瓜汁液里，攪拌均勻。
然後加入果膠酶，每十斤木瓜加入0.1克果膠酶粉末，加入十倍的純淨水，溶解後加入木瓜汁液里，攪拌均勻。
接著進行單向密封發酵，發酵罐裝七分滿，發酵的環境溫度20到30攝氏度，發酵時間是7到15天。
發酵結束後，進行皮渣分離，然後密封，進入兩周的二次發酵階段。
以上兩種方法均可製作出美味的木瓜酒，具體選擇哪種方法可以根據個人口味和喜好來決定。