流星花園故事的主要情節是圍繞四個家庭背景、性格迥異的少年展開的。四個人的關係是圍繞著一場換角風波展開的，一開始兩個人的感情就像是一道流星一樣一閃而過，只留下一地的失落。而兩個人的再次相遇則像是一段花開般絢爛的愛情，為這部青春劇添上了許多甜美而又純真的畫面。
同時，這個故事也講述了親情、友情、愛情、成長、失去以及誤會等等一系列主題，每個人在經歷挫折後都會有自己的成長，明白了什麼是真正的愛情。最後道明寺和花澤類為了心愛的女孩放棄了自己的一切成見，這個結局表達了兩個人深厚的友誼以及兩個人願意為愛放手的人生態度。
此外，劇中經典台詞和人物之間的互動也有很強的感染力，因此《流星花園》在當時成為了一代人的青春回憶。
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