海水缸的pH值一般在7.8到8.4之間，最好穩定在8.2到8.4之間。海水的pH值之所以在這個範圍內，是因為海水中的各種礦物質和微量元素的含量遠高於淡水，使得海水的pH值屬於典型的鹼性水質。如果pH值偏低，珊瑚的骨骼會溶解，水中的NO3會被還原成有毒的NO2，各種元素也會發生化學反應而沉澱。
為了維持海水缸的pH值穩定，可以通過以下幾種方法：
保持通風，讓二氧化碳及時排出水體，尤其是夜間。藻缸晚上開燈，讓藻類光合作用也可以吸收二氧化碳。
及時處理掉生物屍體，定期檢查和清理ATS、藻缸，防止生物死亡後屍體腐敗變質。
使用成品pH提升劑，其本質和石灰水差不多，都是偏鹼性的溶液，但是要非常緩慢的滴加，不可過急。
鋪設珊瑚骨，珊瑚骨會緩慢中和水中的氫離子，釋放氫氧根離子，逐漸提升水中的pH值到正常水平。
需要注意的是，pH值的少量偏低不會造成太大影響，但pH值的短時間較大波動後果嚴重。