溯本清源的意思是追究事物的根本原因，並徹底了解其起源。這個成語通過「溯」字表示逆流而上，追究的意思；「本」字代表事物的根本；「窮」字表示徹底窮盡；「源」字則指事物的源頭。因此，溯本清源比喻追根尋底，追尋事物的根源。