土壤酸化的原因是多方面的，包括自然因素、環境因素、植物自身因素和人爲因素。具體如下：
自然因素。土壤本身的吸附鹼性陽離子的能力較差，特別是在降雨頻繁或降水量大時，土壤中的鹼性離子會被淋失，導致土壤酸化。
環境因素。高溫高溼環境有利於土壤中有機物的厭氧發酵，從而加重土壤酸化，土壤板結時，微生物會將土壤中的硫轉化爲硫酸，增加土壤酸性，土壤有機質含量較低時，土壤的緩衝能力下降，也會加重酸化。
植物自身因素。植物在吸收營養時，根系會分泌酸性物質，以及根細胞通過呼吸作用產生二氧化碳，可加重土壤酸化。
人爲因素。包括大量使用未腐熟發酵的糞肥、忽視鈣鎂等鹼性離子的使用、使用生理酸性肥料等，都會導致土壤酸化。
另外，過量施用氮肥、不合理的灌溉和施肥方式、工業污染造成的酸雨等也是重要的酸化原因。