留抵稅額退稅申請的相關操作流程如下：
登錄電子稅務局。首先，需要登錄所在省份的電子稅務局網站或App。
填寫退稅申請表。登錄後，依次點擊「我要辦稅」「一般退（抵）稅管理」「退抵稅費申請（增值稅制度性留抵退稅）」。
選擇退稅類型。在退稅申請界面，選擇「退抵稅費申請（增值稅制度性留抵退稅）」，然後根據自身企業類型（如小型、微型、特定行業）進行選擇。
核對信息。系統會預填一些基本信息，需要仔細核對，確保所有信息準確無誤。
提交申請。核對無誤後，點擊「保存」並選擇「資料採集」，然後點擊「提交」按鈕完成退稅申請。
此外，如果企業類型劃分為微型企業，可以選擇同時辦理存量和增量留抵退稅。需要注意的是，留抵稅額退稅申請的具體操作流程可能會根據不同省份的稅務局有所差異，因此建議根據當地稅務局的具體指引進行操作。