當發現發票多開時，應該及時處理，以避免給企業帶來稅務風險和額外的稅款負擔。處理多開發票的方法取決於具體情況和發票類型。
對於普通發票：
如果客戶同意退還發票，可以直接將發票衝紅。
如果客戶不同意退還發票，但未來不再與之交易，可以辦理髮票遺失手續並衝紅。
如果客戶同意，可以在發票複印件上加蓋公章作爲記賬依據。
對於增值稅發票：
如果是老客戶，可以溝通後在下一次交易中少開多出的部分。
如果是最後一次交易，需要對方協助辦理開具紅字發票證明。如果對方拒絕，可以向國稅局舉報。
如果發現發票多開的時間尚未跨月，應立即收回所有發票聯次，在當月作廢發票，並重新開具正確金額的發票。如果跨月後發現多開，需要開具紅字發票沖銷原發票，並重新開具正確金額的發票。在開具紅字發票時，必須遵循稅務機關規定的操作流程，特別是增值稅專用發票的處理流程。
需要注意的是，如果單位在明知與實際銷售金額不符的情況下多開具增值稅專用發票，這屬於虛開增值稅專用發票，將受到法律法規的嚴厲處罰。如果是因爲銷貨退回、銷售折讓或原藍字專用發票填開錯誤等情況，應按照稅務總局的相關通知處理。