腐植酸肥料是一種有效的土壤改良劑和植物生長調節劑，可以通過多種方法施用。以下是幾種常見的施用方法：
浸種。適用於提高種子發芽率和促進幼苗髮根。一般使用0.005%至0.05%的濃度，浸泡時間為5至10小時，對於硬殼種子如水稻、棉花等，浸泡時間可達24小時。
浸根或蘸根。在移栽前，使用0.01%至0.05%的腐植酸納或腐植酸鉀溶液浸泡秧苗，以促進髮根和提高成活率。
根外噴灑。將0.01%至0.05%的腐植酸溶液噴灑在作物上，特別是在花期噴施2至3次，傍晚時分噴灑效果更佳。
作基肥。固體腐植酸肥（如腐植酸銨）的用量一般為每畝100至150千克。作為基肥施用時，腐植酸溶液的濃度為0.05%至0.1%，每畝用量為250至400升水溶液，可與農家肥料混合施用。
作追肥。在作物幼苗期和抽穗期前，使用0.01%至0.1%濃度的腐植酸水溶液，每畝用量約250升，澆灌在作物根系附近。
請注意，腐植酸肥料的效果受溫度影響，較低溫度下見效慢，而較高溫度下見效快。此外，腐植酸肥料不能完全替代農家肥和無機肥，需要與其他肥料配合使用效果更佳。