自製水果酵母的過程包括以下幾個步驟：
清洗水果。選擇新鮮水果，徹底清洗乾淨，確保酵液不會因水果上的雜質而發霉變質，有的方法建議保留水果皮，因為酵母通常存在於外皮上。
切割水果。將清洗乾淨的水果切成小塊。
消毒容器。使用前，確保用於發酵的容器已經徹底清洗並消毒，有的方法建議用開水煮沸消毒。
加入糖和水。在容器中加入切好的水果小塊，然後加入少量的糖，糖的目的是為了給酵母提供營養，最後加入礦泉水或涼開水，搖晃容器使糖溶解。
密封發酵。將容器密封，放在大約30度的室溫下發酵，通常需要發酵5天左右，期間每天定時打開容器搖晃，以促進酵母的發酵和氧氣的進入。
觀察變化。在發酵過程中，會看到沉在底部的水果塊浮起來，並產生小氣泡，這是酵母活性增強的表現。
過濾和使用。當發酵到5到7天左右時，酵液活性達到高峰，此時可以將酵液過濾出來使用，剩下的水果塊通常不再需要。
此外，還可以將酵母液與麵粉混合製作天然酵母麵團，用於烘焙。在餵養過程中，一般使用1:1:1的比例，即1份酵母液、1份水、1份麵粉混合均勻。