臺灣唯一的荷蘭人生物遺跡是赤崁草樓遺址。該遺址是荷蘭人在台灣建立的聚落，是台灣最早的基督新教信仰建築，也說明了荷蘭人曾在這裡進行農業耕作，並有原住民在此生活。該遺址內的「大天后宮」有台灣最古老的基督新教壁畫，具有重要的歷史價值。