草本植物和木本植物之間有幾個主要的區別：
莖的結構不同。木本植物的莖含有大量的木質，使得它們更加堅硬和穩固；相比之下，草本植物的莖部是草質的，通常較柔軟。
生長周期不同。木本植物通常是多年生植物，可以持續多年生長；草本植物可以是一年生、二年生或多年生，它們的生命周期較短。
形態不同。木本植物往往比較高大直立，如喬木的主幹明顯，分枝位置較高；草本植物則多樣，從低矮的草類到較高的草本植物都有。
生長習性不同。草本植物的生長習性可能會隨著地理緯度和栽培習慣的改變而變化，例如小麥和大麥在不同的播種時間或地區可能表現為不同生命周期。
對環境因素的適應性不同。草本植物相對而言對水分和通風條件有較高的要求，而木本植物通常具有較強的適應性和耐性。