荷花和睡蓮雖然都是水生植物，但它們之間存在幾個主要的區別：
根系和地下莖。荷花的地下莖（即蓮藕）膨大且可食用，而睡蓮的地下莖則較小，一般不食用。
葉片。荷花的葉片通常較大，高出水面，形狀多樣，而睡蓮的葉片較小，通常漂浮在水面上，並且睡蓮的葉子表面光滑，而荷花的葉子表面有絨毛。
花朵。荷花的花朵通常較大，有單瓣和重瓣的品種，顏色多樣，包括粉紅、白色、黃色等，而睡蓮的花朵相對較小，顏色通常爲白色或粉色，荷花的花朵中央有凸起的花托，而睡蓮的花朵中央的柱頭盤凹陷。
生長環境。荷花一般生長在水深較深的水域中，而睡蓮則生長在水深較淺的湖泊或流水中。
生長速度和花期。荷花生長速度較快，花期較長，能夠持續開花，而睡蓮生長速度較慢，花期較短，只有短暫的幾周時間。
生態作用。荷花具有較強的淨化水質和調節水溫的作用，而睡蓮則主要起到美化水域環境和提供棲息場所的作用。
用途。荷花被廣泛地用於美食、健康食品製作、茶飲料等方面，而睡蓮一般不用作食用。