蛋白質分解成氨基酸的過程主要在人體的消化系統中完成，涉及胃、小腸和胰腺等多箇器官分泌的酶。具體可以細分爲以下幾個階段：
在胃中，胃液中的胃蛋白酶和胃酸開始將蛋白質分解成較小的多肽鏈。
當蛋白質進入小腸，胰蛋白酶、糜蛋白酶、羧肽酶等消化酶繼續將多肽鏈分解成更小的肽段，直至最終分解成單個氨基酸。
這些氨基酸被小腸粘膜的上皮細胞吸收，並進入血液循環輸送到身體各處，用於新蛋白質的合成或身體的生長、修復和維持組織功能。
此外，食物中的蛋白質在口腔中不能被消化分解，需要等到進入胃和小腸後，在胃蛋白酶、胰蛋白酶等多種水解酶的作用下分解爲小分子多肽，然後經腸肽酶分解爲氨基酸。