被子植物和裸子植物的主要區別體現在以下幾個方面：
種子形態和結構。被子植物的種子被果皮包裹，藏在果實裏，而裸子植物的種子則裸露在外，沒有果皮包裹。
葉片形狀。被子植物的葉子通常爲單葉，形狀多樣，而裸子植物的葉子多爲針葉、鱗狀、條形等，形狀相對單一。
花朵形狀。被子植物的花朵通常具有花瓣、花萼、花蕊等部分，而裸子植物的花朵一般呈球果狀，沒有花瓣和花冠。
繁殖方式。裸子植物的繁殖主要靠孢子，而被子植物的繁殖則主要靠種子。
植株大小。被子植物的種類豐富，包括喬木、藤木、灌木以及許多草本植物，植株大小各異。裸子植物一般都是喬木，沒有灌木或矮小的植物。
生存環境。被子植物適應性強，可以在各種環境中生存，而裸子植物適應性相對較弱，主要生活在森林、山地等環境中。
化學元素與生理特性。裸子植物體內通常含有雙黃酮類化合物，而被子植物則不含有這種化合物，但具有其他類型的次生代謝產物。