根據提供的信息，西安待遇最好的研究所可以總結如下：
第一次梯隊：
504研究所：位於中國空間技術研究院西安分院，隸屬於中國航天科技集團有限公司第五研究院，主要從事空間飛行器有效載荷、國防裝備和航天技術套用產品的研製。該所技術雄厚，專業齊全，設施先進，人才輩出。待遇方面，應屆碩士到手20萬+，具體還要看崗位和專業。
- 203研究所（西安現代控制技術研究所）：主要業務包括陸軍總體單位，涉及陸軍兵種的研發。人均收入超過618，地理位置好，位於丈八東路上。薪酬待遇含年終獎，具體數額根據學歷和職位不同而有所差異。
- 705研究所：具體信息未詳細列出，但被提及為西安最好的三個研究所之一，待遇應屆碩士到手20萬+，具體還要看崗位和專業。
第二梯隊：
航天六院165所、11所、41所、401所：中航工業一飛院、試飛院、強度所等，第一年稅後到手16萬左右，加班和出差適中，總體性價比不錯。
第三梯隊：
兵器206、電科20所、39所：應屆碩士月到手1萬左右，工資較低，壓力較大，加班和出差都很多，適合雙211或者本雙非碩211去。
綜上所述，504研究所因其隸屬於中國航天科技集團有限公司第五研究院，且主要從事空間飛行器有效載荷、國防裝備和航天技術套用產品的研製，技術雄厚，專業齊全，設施先進，人才輩出，被認為是在西安待遇最好的研究所之一。其他如203研究所和705研究所也因其優越的待遇和地理位置被列為待遇較好的研究所。