迷你忍者的玩法主要包括以下幾個方面：
遊戲開始：點擊開始遊戲後，可以使用滑鼠點擊控制忍者進行跳躍、行走和暫停等操作。
路線指引：在迷你忍者遊戲中，當玩家不知道往哪走時，可以按住E鍵開啟系統路線指引。注意看頭上的小箭頭。
角色替換：遊戲進行時，玩家可以陸陸續續拯救自己的同伴，之後便可以選擇拯救的同伴來遊戲，一次只能讓一位忍者上場戰鬥。可選用角色包括主角弘，唯一能使用忍術的角色，以及浮屠，拿著大錘體型龐大的忍者，擅長對抗體型跟他一樣龐大的敵人。
遊戲進程：遊戲開始後，玩家需要跟隨提示熟悉遊戲的操作，然後找到大師的道場，出門左走一個右手邊的大房子既是。大師會叫我們去找紅色花朵，紅色花朵長在道場周圍，沿著邊繞一圈即可。之後可以根據地圖的指示去完成任務。
物品用途：遊戲中的物品包括花（藥材）、動物（解救後會給你經驗）、金幣（用來買配方）和地藏（全部100個，有收集欲望的可以收集）。
以上就是迷你忍者遊戲的基本玩法，玩家在遊戲中需要靈活運用各種操作和策略，才能順利完成任務。