《環太平洋2：雷霆再起》的劇情發生在第一部電影的十年之後，背景設定在2035年。故事開始時，人類以為怪獸不再來襲，地球上的蟲洞被堵上後，世界得以重建。然而，外星「先驅」再次打開海底蟲洞，釋放了更加龐大且智慧的怪獸，人類社會再次面臨威脅。
面對機甲駕駛員的短缺，曾經的機甲駕駛員搭檔傑克（約翰·波耶加飾）和奈特（斯科特·伊斯特伍德飾）再次聯手，領導一支包括從未有過實戰經驗的機甲學員在內的抵抗力量。他們的目標是守護人類最後的希望，與怪獸展開激烈戰鬥。
電影中還引入了其他重要角色，如景甜飾演的邵麗雯，她極力推行「無人機甲」計劃，並在戰鬥中發揮了關鍵作用。查理·戴飾演的紐頓博士，作為「怪獸科學部」的成員，研究怪獸的起源與弱點。
劇情中包含多個轉折和衝突，包括人類內部的糾葛和對抗。例如，一個名叫阿瑪拉的年輕女孩，因家人被怪獸殺死而發誓要消滅所有怪獸，她通過盜竊拼湊成一個機甲戰士。此外，紐特博士被外星怪物控制，協助打開蟲洞，導致三個外星怪獸降臨地球。
在戰鬥的高潮部分，正義力量派出機甲阻止怪獸引爆東京富士山的計劃。在一場機甲與怪獸的決戰中，人類運用智慧和勇氣最終取得了勝利。
總體來說，《環太平洋2：雷霆再起》不僅展示了機甲與怪獸之間的激烈戰鬥，還深入探討了人類面對挑戰時的團結和勇氣。儘管劇情在某些觀眾看來可能不夠流暢，但特效和動作場面仍然受到好評。