預繳所得稅的計算方法根據不同情況有所區別。對於企業而言，通常有以下幾種計算方式：
按照季度的實際利潤計算應納稅額進行預繳。如果按季度實際利潤額計算預繳有困難，可以按上一年度應納稅所得額的1/4計算，或者按年度計劃利潤額計算。
實際利潤額乘以適用稅率，再減去本年以前季度實際已預繳企業所得稅額。
居民個人預扣預繳方法包括：
工資、薪金所得。扣繳義務人向居民個人支付工資、薪金時，應按累計預扣法計算預扣稅款，具體計算公式為：本期應預扣預繳稅額=（累計預扣預繳應納稅所得額×預扣率-速算扣除數）-累計減免稅額-累計已預扣預繳稅額。累計預扣預繳應納稅所得額等於累計收入減去累計免稅收入、累計基本減除費用、累計專項扣除、累計專項附加扣除，以及累計依法確定的其他扣除。
勞務報酬所得、稿酬所得。扣繳義務人按次或按月預扣預繳個人所得稅。
非居民個人的扣繳方法與居民個人類似，但可能涉及不同的稅率和扣除規則。總體來說，預繳所得稅的計算涉及多個因素，具體方法依據納稅人的身份、所得類型以及稅務機關的規定而定。