DAPI（4',6-二脒基-2-苯基吲哚）是一種具有以下作用的螢光染料：
DNA染色：DAPI能夠穿透細胞膜並與細胞核中的雙鏈DNA結合，形成螢光複合物。這種結合使得DAPI對DNA的染色靈敏度遠高於EB（溴化乙啶）。DAPI染色後，在螢光顯微鏡下可以觀察到發出藍色螢光的細胞。
活細胞和固定細胞染色：DAPI不僅可以用於固定細胞的染色，也能用於活細胞的染色，儘管活細胞染色對DAPI濃度有嚴格要求。它能夠快速進入活細胞中與DNA結合，因此在生物學研究中被廣泛套用。
螢光顯微鏡觀測：DAPI與DNA結合時產生的強螢光使其成為螢光顯微鏡技術中DNA染色的理想選擇。在螢光顯微鏡下，DAPI染劑在358nm（紫外線）處有一個最大吸收峰，並在461nm（藍）處有一個最大發射峰，其發射光的波長範圍含蓋了藍色至青綠色，因此在螢光顯微技術中DAPI被紫外線照亮且被藍或青色濾鏡檢出。
流式細胞術套用：DAPI可用於流式細胞術中作為DNA染料，幫助定量給細胞中的DNA染色。這一套用有助於研究細胞周期、細胞凋亡等生物學過程。
特定情況下的套用：DAPI也常用於普通的細胞核染色以及某些特定情況下的雙鏈DNA染色，如細胞凋亡檢測。染色後，可以使用螢光顯微鏡觀察或流式細胞儀檢測。
需要注意的是，DAPI對生物體而言被視為一種毒性物質與致癌物，儘管在MSDS中它被標記為無毒。此外，由於DAPI可以摻入DNA螺旋中，它可能具有底層的DNA誘變性，因此應小心配置和使用DAPI。