使用iQOS的步驟如下：
充電。首先，將iQOS充電器連接到電源，然後將iQOS設備插入充電器。充電時，所有指示燈會呈現綠色閃爍。大約40分鐘後，當指示燈熄滅時，表示設備已充滿電。
放入加熱棒到主機中。在主機中放入加熱棒，應底部插入，不可扭轉放入。如果主機指示燈爲橙色，請取出加熱棒重新放入，確保插到位。如果指示燈爲深紅色，則加熱棒可能已損壞。
放入煙彈。將煙彈輕輕按下尾部，不要扭轉，以避免加熱片損壞。抽完煙後，加熱棒的顯示燈熄滅，輕輕頂一下加熱棒帽子，再取出煙彈，以防菸絲掉進加熱片裏。
使用加熱棒。加熱棒的顯示燈熄滅後，即可開始吸菸。吸菸時不需要大口猛吸或頻率過快，以免外部冷空氣流入造成傷害。抽完一支菸後，應讓加熱棒冷卻後再放入充電盒。
此外，iQOS充電盒上有多箇按鍵，包括電源開關鍵、清潔功能鍵（Q鍵，日版爲Q鍵，歐版有藍牙鍵）等。在充電盒最側邊，還有按鍵用於清潔功能，但具體效果需根據產品說明。